ഡല്‍ഹി, മുംബൈ, ചെന്നൈ എന്നിവിടങ്ങളില്‍ നിന്നുള്ള ട്രെയിനുകളുടെ പ്രധാന ജംങ്ഷനാണ് മഥുര. മെട്രോപൊളിറ്റന്‍ സിറ്റികളായ ഡല്‍ഹി, കൊല്ക്കൊത്ത, ചെന്നൈ എന്നിവിടങ്ങളില്‍ നിന്ന് യഥാക്രമം ശതാബ്ധി എക്സ്പ്രസ്, തൂഫാന്‍ എക്സ്പ്രസ്, ജി.ടി.(ഗ്രാന്‍ ഡ് ട്രങ്ക്‍) എന്നിവ പതിവായി മഥുരയിലേക്ക് വന്നുപോകുന്നുണ്ട്.